El objetivo de la Comisión es garantizar, mediante una ordenación adecuada, la conservación y la utilización óptima de la pesquería de SBT mundial.
La Comisión también ofrece un foro internacionalmente reconocido para otros países o entidades a participar activamente en las cuestiones de SBT.
La Comisión para la Conservación del Atún del Sur ha establecido una lista de los buques de pesca y lista de buques de transporte que estén autorizados para pescar o transportar atún rojo del sur.