La Sanidad Animal y Vegetal del Servicio de Inspección es una Agencia polifacética con una amplia zona de la misión, que incluye la protección y promoción de la salud agrícola de EE.UU., que regula los organismos genéticamente modificados, la administración de la Ley de Bienestar Animal y la realización de actividades de manejo de vida silvestre daños. Estos esfuerzos de apoyo a la misión general de la USDA, que es proteger y promover la alimentación, la agricultura, los recursos naturales y temas relacionados.
Para proteger la sanidad agropecuaria, el APHIS está en el trabajo de 24 horas al día, 7 días a la semana de trabajo para defender a los animales de Estados Unidos y los recursos vegetales de plagas y enfermedades agrícolas. Por ejemplo, si la mosca mediterránea de la fruta y el escarabajo asiático de cuernos largos, dos de las plagas agrícolas más importantes, se deja sin control, que daría lugar a varios miles de millones de dólares en pérdidas de producción y comercialización de cada año. Del mismo modo, si la fiebre aftosa o la influenza aviar altamente patógena fueron a establecerse en los Estados Unidos, los socios de comercio exterior pueden invocar las restricciones comerciales y los productores que sufren pérdidas devastadoras.