Donald Van Doornik, biólogo de pesca de la NOAA, procesa muestras genéticas de salmón. Foto: NOAA/FIS

El salmón Chinook de la Costa Oeste obtiene una nueva base de datos de referencia genética

ESTADOS UNIDOS
Monday, September 30, 2024, 00:00 (GMT + 9)

Una herramienta de investigación mejorada permite a los científicos determinar el origen de cada salmón.

Los científicos de la NOAA han mejorado una herramienta crucial para la conservación del salmón Chinook. Esta herramienta de referencia genética permite a los investigadores determinar el sistema fluvial del que proviene cada pez, lo que permite una gestión y protección más precisas de las poblaciones amenazadas y en peligro de extinción.

"Es como darle a cada pez una huella genética única", dice Donald Van Doornik, biólogo de peces de la NOAA Fisheries y autor principal de un nuevo artículo que describe el trabajo en el North American Journal of Fisheries Management. "Podemos usar esta huella para averiguar de dónde proviene ese pez comparándola con el ADN de otros peces".

Creación de una base de datos genética integral para el salmón Chinook

La identificación genética de poblaciones es un método científico utilizado para determinar el origen de un organismo individual, como un pez, analizando su composición genética. Los científicos comparan el ADN de un individuo desconocido con una base de datos de referencia de poblaciones conocidas. Pueden identificar la población o stock más probable de la que se originó el individuo o la composición de mezclas de peces capturados en el océano.

Si pudiéramos identificar las poblaciones específicas de Chinook que contribuyen a las pesquerías de stock mixto, entonces podríamos diseñar estrategias de conservación y gestión más efectivas.

Mapa de las ubicaciones de las muestras de las poblaciones de salmón Chinook en Rusia y Alaska. Cst, costa; R, río; Up, superior. | Haga clic en la imagen para ampliarla

Sin embargo, el desarrollo de bases de datos genéticas integrales para especies con amplias áreas geográficas, como el salmón Chinook, ha sido un desafío. La especie tiene una vasta distribución geográfica y una composición genética diversa. Las limitaciones de los datos genéticos y la tecnología existentes también han obstaculizado el desarrollo de una base de datos de identificación genética confiable y de rango amplio para el salmón Chinook.

Otros investigadores desarrollaron una base de datos genética para toda la costa para el salmón Chinook utilizando microsatélites, que son simples repeticiones de bases genéticas en el genoma, hace más de una década. Sin embargo, esta técnica es difícil de estandarizar entre laboratorios y proporciona información limitada en comparación con los nuevos métodos. La base de datos actualizada utiliza tecnología más nueva que examina secuencias genéticas y diferencias de bases individuales entre individuos y poblaciones.

Una herramienta genética para determinar el origen de un salmón Chinook

Investigadores federales, estatales, tribales y académicos en toda la Costa Oeste recopilaron datos genéticos de varias fuentes en todo el rango geográfico del Chinook. Luego, armaron una base de datos genética que los científicos pueden usar para identificar con precisión el origen de un salmón. Pruebas y simulaciones rigurosas aseguraron la confiabilidad de la base de datos. Finalmente, emplearon un enfoque de análisis jerárquico para identificar el hogar específico de un salmón.

Al recopilar, estandarizar y analizar el ADN de miles de salmones de varias poblaciones, los investigadores desarrollaron una referencia genética estandarizada para Chinook. Identificar con precisión el origen de cada salmón individual permite a los administradores tomar decisiones informadas sobre las cuotas de captura, proteger a las poblaciones en peligro de extinción y monitorear la salud de diferentes poblaciones. Los científicos también pueden usar esta información para estudiar los patrones de migración, la diversidad genética y el impacto de pesquerías específicas y factores ambientales en las poblaciones de salmón.

Fuente: NOAA Northwest Fisheries Science Center 

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